换一批新疆汉族食管鳞癌差异表达长链非编码RNA的筛选与分析
Screening and analysis of long non-coding RNA differential expression in Xinjiang Han patients with esoph-ageal squamous cell carcinoma
摘要目的:全基因组关联分析食管癌组织中长链非编码RNA(lncRNA)表达水平的改变及其意义.方法:通过基因芯片技术筛选了6对食管癌及其癌旁正常组织中差异表达的lncRNA和mRNA,通过靶基因预测,利用基因本体论(GO)和Pathway进一步分析lncRNA的功能.结果:差异表达(2倍以上变化且P<0.05)lncRNA共680个,其中161个lncRNA表达上调,519个lncRNA表达下调;差异表达mRNA共1472个,其中653个mRNA上调,819个mRNA下调.GO和通路分析表明这些差异表达基因参与11条可能与食管鳞癌相关的通路,包括翻译后蛋白修饰调节,粘蛋白O型聚糖的生物合成和鞘糖脂代谢途径等通路,主要涉及分子功能、细胞成分和生物过程的改变.通过顺式和反式调控分析发现共有11个lncRNA有cis-调控的靶基因,1个lncRNA有trans-调控的靶基因,3个lncRNA同时有cis-和trans-调控的靶基因.结论:与癌旁正常组织相比,新疆汉族食管癌组织中lncRNA的表达水平明显改变,差异表达的lncRNA可能通过某些信号通路参与食管癌的发生发展,对进一步寻找食管鳞癌诊断和治疗相关的新的靶点具有重要意义.
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栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1006-5725.2017.11.022
发布时间
2017-08-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（81260362）
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