换一批基于转录组测序探究C-MET表达在非小细胞肺癌中的免疫调控机制
RNA sequencing-based research on the immune regulation mechanism of C-MET in lung cancer
摘要目的 通过转录组测序技术分析C-MET表达在非小细胞肺癌中的免疫调控机制.方法使用siRNA分子干扰技术将C-MET高表达肺腺癌细胞株(H1993)、肺鳞癌细胞株(EBC-1)的C-MET表达沉默,利用转录组测序技术检测C-MET沉默前后细胞差异表达的基因(DEGs),通过生物信息学分析挖掘出C-MET可能参与调控的免疫微环境信号通路及相关基因.最后使用人免疫细胞与H1993、EBC-1共培养技术验证C-MET对免疫因子(INF-γ、INF-β、CXCL-10)的影响.结果 通过转录组测序技术共检测到505个DEGs,其中H1993的C-MET调控前后表达差异组的表达差异基因共有38个,上调的差异表达基因有24个,下调的差异表达基因有14个.EBC-1的C-MET调控前后表达差异组的表达差异基因共有467个,上调的差异表达基因有347个,下调的差异表达基因121个.差异基因的KEGG分析表明,C-MET表达可能通过白细胞介素(IL-17)信号通路、白细胞分化、细胞因子受体活性、细胞周期、细胞因子-细胞因子受体相互作用参与免疫细胞调节因子的调控.使用肺癌细胞与人免疫细胞共同培养技术验证C-MET对免疫因子分泌的影响,Rt-qPCR检测结果提示:与C-MET高表达组共培养的PBMC中干扰素(INF-γ)的mRNA转录水平是低表达组的77倍、CXCL-10的mRNA转录水平是低表达组的1.6倍,INF-β的mRNA转录水平是低表达组的2倍.结论 C-MET表达可能通过IL-17信号通路、白细胞分化、细胞因子受体活性通路参与肿瘤周围免疫微环境调控.
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关键词
非小细胞肺癌C-MET免疫微环境表达谱测序non-small cell lung cancerC-METimmune microenvironmentexpression profile sequencing
分类号
R734.2（呼吸系肿瘤）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1006-5725.2024.01.002
发布时间
2024-01-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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