MZB1的可变剪接事件是乳腺癌内分泌治疗耐药的潜在生物标志物

The alternative splicing event of MZB1 is a potential biomarker of drug resistance in endocrine therapy of breast cancer

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摘要目的利用生物信息学方法,整合基因表达谱和剪接谱,鉴定在内分泌治疗耐药中发挥作用的潜在生物标志物.方法从基因表达综合数据库(Gene expression omnibus,GEO)下载内分泌治疗敏感细胞和耐药细胞的基因数据集,筛选与内分泌治疗耐药相关的差异表达基因和差异剪接基因,并对这些基因进行Hallmark富集分析和基因集富集分析(Gene set enrichment analysis,GSEA).下载癌症基因组图谱(The cancer genome atlas,TCGA)和乳腺癌国际联盟分子分类数据库(Molecular taxonomy of breast cancer international consortium,METABRIC)中的乳腺癌数据,比较差异基因在肿瘤组织和癌旁组织中的表达情况以及在不同肿瘤分期、分级之间的差异.探索差异基因与接受内分泌治疗患者的总生存期(Overall survival,OS)的关系及其可变剪接情况以及免疫浸润情况.结果 GEO数据分析显示,差异表达基因主要富集在乳腺癌治疗反应相关通路和免疫相关通路,差异剪接基因主要富集在乳腺癌治疗反应相关通路.同时发生差异表达和差异剪接的基因有CAMK2B、EVL、MZB1 和PTPRG.其中,MZB1 表达与接受内分泌治疗患者的OS以及免疫细胞浸润均相关,且在耐药细胞中MZB1 的前体mRNA发生更多的可变 3'端剪接.结论 MZB1 表达与乳腺癌内分泌治疗疗效相关,其机制可能是通过发生可变剪接引起免疫相关功能的改变.MZB1 可作为内分泌治疗改善预后的潜在生物标志物.