基于生物信息学分析IGF2BP基因家族在肝癌中的预后价值及中药靶向治疗的研究

Analysis of prognosis and mechanism of IGF2BP family members in liver hepa-tocellular carcinoma based on bioinformatics and targeted therapy of traditional Chinese medicine

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摘要目的研究胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白(IGF2BP)家族在人类肝癌中的表达和预后价值.方法通过ULCAN数据库分析IGF2BP基因家族在肝癌中的表达水平.采用Kaplan-Meier plotter数据库评估IGF2BP基因家族的表达与肝癌患者预后的相关性,使用LinkedOmics数据库探索IGF2BP家族在TCGA肝癌患者组织中共表达基因情况,通过DAVID数据库对差异基因进行KEGG通路富集分析,通过cBioPortal数据库分析IGF2BP家族的表达与甲基化相关性,并基于TIMER数据库分析IGF2BP基因家族与各种肿瘤浸润免疫细胞的相关性.结果 IGF2BP 基因家族在肝癌组织中呈高表达.IGF2BP1、IGF2BP2 和IGF2BP3 的高表达与肝癌患者总生存率显著相关.与IGF2BP1 和IGF2BP2 表达存在互作的差异性基因有ARID3A、SALL2、C2orf29、SALL2、SALL4,与 IGF2BP3 表达关联紧密的基因有 MYBL2、KIF2C、DEPDC1B、TTK、KIAA1524、BLM等.它们主要富集在代谢途径、视黄醇新陈代谢、咖啡因代谢、药物代谢-细胞色素P450、细胞周期、化学致癌作用、DNA复制等通路.在肝癌中IGF2BP家族的高表达与甲基化相关,IGF2BP基因家族的表达与6 种肿瘤免疫细胞变化相关.结论IGF2BP家族的表达与预后、甲基化密切相关,其可能通过影响免疫细胞的浸润相关通路调控肝癌的发生与发展,有望作为肝癌的潜在治疗靶标.