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高通量DNA测序数据压缩研究进展

Advances in the compression of high-throughput DNA sequencing data

摘要针对高通量DNA测序技术发展产生的DNA测序数据量猛增,数据压缩技术是解决存储和传输高通量DNA序列数据问题的重要方法之一.评述DNA测序数据传统压缩方法包括替代法和统计法,以及基于参考基因组的高通量DNA测序数据压缩方法,介绍并比较重测序数据压缩、从头测序数据压缩、质量分数压缩和压缩数据检索的代表性算法,研究高通量DNA测序数据压缩面临的挑战及对未来的展望.

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作者 朱泽轩 [1] 张永朋 [1] 尤著宏 [1] 姜亮 [2] 纪震 [1] 学术成果认领
作者单位 深圳市嵌入式系统设计重点实验室,深圳大学计算机与软件学院,深圳518060 [1] 深圳大学生命科学学院,深圳,518060 [2]
分类号 TP391TP319
栏目名称 电子与信息科学
DOI 10.3724/SP.J.1249.2013.03409
发布时间 2013-10-17
基金项目
National Natural Science Foundation of China (61211130120,61001185)国家自然科学基金资助项目
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