摘要针对高通量DNA测序技术发展产生的DNA测序数据量猛增,数据压缩技术是解决存储和传输高通量DNA序列数据问题的重要方法之一.评述DNA测序数据传统压缩方法包括替代法和统计法,以及基于参考基因组的高通量DNA测序数据压缩方法,介绍并比较重测序数据压缩、从头测序数据压缩、质量分数压缩和压缩数据检索的代表性算法,研究高通量DNA测序数据压缩面临的挑战及对未来的展望.
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关键词
计算机应用DNA测序下一代测序重测序从头测序高通量测序数据压缩算法computer applicationDNA sequencingnext generation sequencingresequencingde novo sequencinghigh-throughput sequencingdata compression
栏目名称
电子与信息科学
DOI
10.3724/SP.J.1249.2013.03409
发布时间
2013-10-17
基金项目
National Natural Science Foundation of China (61211130120,61001185)国家自然科学基金资助项目
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