换一批摘要目的 明确中药高良姜转录组简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)位点信息特征.方法 以高良姜转录组测序所得的147 652条unigene为数据,采用MISA软件检索其中的SSR位点,并通过Primer 5.0软件对符合标准的SSR位点进行引物设计并随机挑选10条引物进行PCR验证.结果 在高良姜转录组共搜索到13 346个SSR位点,分布于11140条unigene中,出现频率为9.04％.三、二核苷酸重复是高良姜主要的SSR类型,分别占比41.99％和39.97％.AAG/CTT、AG/CT分别是三、二核苷酸重复的优势重复基序.设计筛选出30 348条引物,随机挑选的10对引物中有8对可扩增出与预期相符的产物.结论 高良姜转录组SSR位点出现频率高、类型丰富、多态性潜能较高,可为高良姜种质鉴别、分子标记辅助育种及种质资源保护等研究提供科学依据.
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分类号
R282.5（中药学）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1008-0805.2022.02.33
发布时间
2022-04-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
广东省自然科学基金博士启动项目（2015A030310519）
广东省中医药局中医药科研项目（20211224）
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