换一批基于转录组和蛋白组的少棘巨蜈蚣足色差异分析
Transcriptome and proteome analysis revealed the diversity of the foot color of Scolopen-dra subspinipes mutilans L.Koch
摘要目的 基于湖北黄足蜈蚣(HY)、湖北红足蜈蚣(HR)和浙江舟山红足蜈蚣(ZR)的转录组和蛋白组数据,分析其足色差异的形成机制.方法 利用llumina高通量测序技术和质谱检测平台对以上3个批次各取3条蜈蚣进行转录组和蛋白组测序,从头组装获得Unigene,筛选出差异表达基因和差异表达蛋白,并对其进行GO和KEGG富集分析.结果 (1)9个蜈蚣样品共获得71351个Unigenes和1688个蛋白质;(2)在HY vs HR组差异表达基因数量为6个,在HR vs ZR组、HY vs ZR组差异表达基因数量为1579和2567个,湖北地区的黄足和红足蜈蚣基因表达水平相近、湖北地区蜈蚣与浙江舟山地区蜈蚣基因表达水平差异较大;(3)在KEGG富集分析中,找到影响动物体色的黑素原生成相关的差异表达基因和差异表达蛋白.结论 根据湖北和舟山地区差异表达基因数量的差异和差异表达蛋白的通路富集结果,推测产地环境对蜈蚣生长发育影响较大,蜈蚣足色差异主要与黑色素合成途径相关.
更多相关知识
分类号
R282.5（中药学）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1008-0805.2022.11.28
发布时间
2023-03-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
湖北省中央引导地方科技发展专项（2019ZYYD063）
湖北省武汉市第五批黄鹤英才计划人才项目
- 浏览0
- 被引2
- 下载0
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
