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数据驱动的科学工作流及其在生物医学中的应用实践

Data Driven Scientific Workflow and Its Application in Biomedicine

摘要E-Science关注数字环境下的科研活动,然而随着生物医学大数据的爆发,数据密集型科学研究为e-Science带来了新的挑战。科学工作流通过形式化科学计算的流程,支持在一个专门的程序环境下自动协调多任务多步骤的处理,从而减少科研投入,提高科研效率。文章首先归纳并总结了科学工作流的相关定义,然后分析了当前主流的科学工作流系统,提出科学工作流处理如何应对密集的生物医学数据,并基于Taverna开展了生物医学领域的科学工作流实验。最后总结了科学工作流当前的研究现状和存在的一些问题。

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作者 洪娜 [1] 钱庆 [1] 方安 [1] 吴思竹 [1] 杨林 [1] 学术成果认领
栏目名称 知识组织
DOI 10.3772/j.issn.1673-2286.2014.03.004
发布时间 2014-04-22
基金项目
国家“十二五”科技支撑计划项目课题“科技知识组织体系共享服务平台建设” 国家社会科学基金项目“关联数据中潜在知识关联的发现方法研究” 中央级公益性科研院所基本科研业务费课题“面向大数据的医学科研支撑环境建设初步研究”(编号13R0102)的研究成果之一。
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