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博来霉素致C57小鼠肺纤维化分子靶点的探寻

Searching for Molecular Targets in Pulmonary Fibrosis Induced by Bleomycin in C57 Mouse

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摘要目的探寻博来霉素(BLM)致C57小鼠肺纤维化分子靶点.方法应用BRB-ArrayTools软件中justRMA算法分析BLM(实验组)和生理盐水(对照组)作用于C57小鼠1、3、14 d后肺组织基因表达谱数据集GSE485,找出差异表达基因;应用DAVID在线工具对这些基因进行功能聚类,结合<京都基因与基因组百科全书>和BioCarta进行生物学通路分析;应用MSigDB搜寻[-2kb,2kb]区域富集的转录因子结合位点.结果分别筛选出190、345、527个差异表达基因;按功能显著聚集的有趋化因子、膜蛋白、血清蛋白、补体成分、免疫球蛋白、钙黏蛋白、基质金属蛋白酶、前胶原类;受调控的有%11样受体、CCR5、ECM受体、补体途径、TGF-β生物学通路;富集度较高的有API、SRF、NFKAPPAB转录因子.结论 API、SRF和RhoA可能是BLM致C57小鼠肺纤维化的分子靶点.

作者黄冬冬 ^[1] 王尉平 ^[2] 顾振纶 ^[3] 蒋小岗 ^[3] 周文轩 ^[4] 郭次仪 ^[4] 学术成果认领

作者单位苏州大学医学部生物化学与分子生物学系,江苏苏州215123;苏州中药研究所,江苏苏州215007 ^[1] 苏州大学医学部生物化学与分子生物学系,江苏苏州,215123 ^[2] 苏州中药研究所,江苏苏州215007;苏州大学衰老与神经疾病实验室,江苏苏州215123 ^[3] 苏州中药研究所,江苏苏州215007;香港保健协会,香港 ^[4]

关键词博来霉素肺纤维化差异表达基因生物学通路转录因子小鼠

医学主题词小鼠(Mice)肺纤维化(Pulmonary Fibrosis)博来霉素(Bleomycin)基因(Genes)生物学(Biology)

分类号 R563.902（呼吸系及胸部疾病）

栏目名称

基础医学

发布时间 2010-07-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

基金项目

香港保健协会资助项目（20050916-2HK）