换一批
换一批基于生物信息学整合分析探讨青光眼高压反应性视神经星形胶质细胞相关核心基因
Hub Genes of Astrocyte Involved in Glaucoma with Ocular Hypertension by Integrated Bioinformatics Analysis
摘要目的 本研究旨在挖掘星形胶质细胞对于青光眼伴高眼压影响的潜在关键候选基因和相关通路.方法 整合并深入分析表达谱GSE2378和GSE758,其中包括26例正常对照的27例高压反应性视神经星形胶质细胞(ONHA).对差异表达的基因(DEG)进行分选,分析候选基因和富集途径,并进行DEGs相关的蛋白质相互作用(PPI)网络分析.结果 从281个常见变化的DEG中共鉴定出119个一致表达的基因,其中包括68个表达上调基因和51个表达下调基因.119个表达一致的基因中,有75个(43个表达上调基因和32个表达下调基因)构成PPI网络,形成了117个蛋白相互作用的关系,并鉴定了10个核心基因.经PPI网络互作分析鉴定了3个相关性模块,通路富集分析显示模块1与细胞外的外泌体相关,模块2主要与抗体依赖性细胞毒性(ADCC)相关,模块3主要与Hippo信号传导途径相关.结论 采用整合生物信息学分析,确定了星形胶质细胞参与青光眼合并高眼压的DEGs相关候选基因和相关通路,这可以提高我们对病因和潜在分子事件的认识,这些候选基因和通路可能是青光眼的治疗靶点.
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关键词
青光眼眼高压反应性视神经乳头星形胶质细胞核心基因通路富集GlaucomaOcular hypertensionReactive optic nerve head astrocytesHub genePathway enrichment
发布时间
2019-12-13
基金项目
We thank for the finding support from the China National Natural Science Foundation Funding Project
Hunan University of Chinese Medicine, National Key Discipline of TCM Diagnostics Foundation Funding Project
The Domestic First-class Discipline Construction Project of Chinese Medicine of Hunan University of Chinese Medicine
Hunan Provincial Department of Education Innovation Platform Open Fund Project
Chinese Medicine Key Laboratory of Prevention and Treatment of Disease in Hunan Province
Changsha Science and Technology Plan Project
Hunan Engineering Technology Research Center for the Prevention and Treatment of Otorhinolaryngologic Diseases and Protection of Visual Function with Chinese Medicine
Hunan Provincial Research Innovation Project for Graduate students
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