换一批基于结构的虚拟筛选预测斜蛛属蜘蛛毒液天然抑制剂
Structure-based virtual screening to predict Loxosceles spider venom natural inhibitors
摘要目的 世界范围内斜蛛属蜘蛛咬伤事故不断增多,急需探索天然抑制剂来抑制最显著的鞘磷脂酶D和透明质酸酶.方法 通过 DrugRep 服务器使用中药抗鞘磷脂酶D(PDB ID:2F9R)和透明质酸酶进行虚拟筛选.通过同一服务器预测吸收、分布、代谢和排泄(ADME)参数.此外,使用CABS-flex 2.0工具进行分子动力学模拟,确定潜在最佳天然抑制剂的优先次序.结果 从分子对接和 ADME 参数来看,中药抑制抗鞘磷脂酶D和透明质酸酶的天然抑制剂中,Tiliroside和 Digitoxin 表现最佳.而洋地黄毒苷和β-胡萝卜素是对透明质酸酶最有效的抑制剂.分子动力学模拟证明了对接复合物的稳定性.结论 通过中药对斜蛛属蜘蛛毒液酶的计算机模拟抑制得到证明,值得开展湿实验分析.
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关键词
斜蛛属蜘蛛鞘磷脂酶D中医药分子对接分子动力学模拟吸收、分布、代谢与排泄(ADME)Loxosceles spiderSphingomyelinase D(Smase D)Traditional Chinese medicine(TCM)Molecular dockingMolecular dynamics(MD)simulationsAbsorption,distribution,metabolism,and excretion(ADME)
DOI
10.1016/j.dcmed.2023.03.001
发布时间
2023-05-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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