基于网络药理学及分子对接技术探讨芪贞降糖颗粒治疗糖尿病视网膜病变的机制研究

Study on the Mechanism of Qizhen Jiangtang Granule in the Treat-ment of Diabetic Retinopathy Based on the Network Pharmacology and Molecular Docking

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摘要通过网络药理学和分子对接的方法,揭示并验证芪贞降糖颗粒治疗糖尿病视网膜病变(DR)的潜在作用机制.检索TCMSP数据库并获取芪贞降糖颗粒的成分及靶点信息;利用UniProt数据库获取药物靶点的基因符号;检索GeneCards,OMIM和DrugBank等数据库并获取DR相关靶点的基因符号;将药物的活性成分靶点与DR相关靶点取交集作为药物疾病的交集靶点;将交集靶点导入String平台中获取PPI信息;利用Metascape平台进行GO生物学过程和KEGG通路富集分析;运用Cytoscape软件构建相关网络图;筛选核心靶点及其相应的活性成分后通过AutoDockTools和AutoDock Vina软件进行分子对接验证,利用PyMOL软件可视化,共筛选出芪贞降糖颗粒的81个有效成分和230个靶点,2222个DR相关靶点,两者交集靶点124个.GO富集分析得到1 856个条目,芪贞降糖颗粒治疗DR与细胞对脂质的反应、激素、脂多糖和凋亡等生物学过程相关.KEGG通路富集分析得到193条生物学通路,主要集中在脂质和动脉粥样硬化、PI3K-AKT及糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路等.分子对接结果显示,核心靶点AKT1、BCL2、PRKCA和MAPK1可以与相应的活性成分良好对接.芪贞降糖颗粒可能通过槲皮素、山柰酚和木犀草素等有效成分作用于AKTl、BCL2、PRKCA和MAPK1等靶点,抑制凋亡和炎症等发挥治疗DR的作用.