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山羊EGR4、KDM4C和KDM6A多态性及其与繁殖性能关联分析

Analysis ofEGR4,KDM4C and KDM6A Polymorphisms in Goats and The-ir Association with Reproductive Performance

摘要本研究旨在分析EGR4、KDM4C和KDM6A单核苷酸多态性(SNPs)与山羊繁殖性状的关联.利用MassARRAY?SNP分型技术对EGR4、KDM4C和KDM6A的SNPs位点进行分型,检测其在云上黑山羊(n=544)、济宁青山羊(n=133)和辽宁绒山羊(n=91)3个群体中的遗传学特征,并将其多态性与繁殖性状表型(产羔数、初生窝重、断奶窝重)进行关联分析.群体遗传学结果表明,EGR4 g.11029053G>T和g.11029600T>A位点在云上黑山羊中为中度多态(0.25<PIC<0.5),在济宁青山羊和辽宁绒山羊中为低度多态(PIC<0.25),EGR4 g.11028295G>A位点在3种山羊群体中为低度多态(PIC<0.25);KDM4C g.37764228T>A位点在济宁青山羊中为中度多态(0.25<PIC<0.5),KDM4C g.37767773T>A和g.37768026C>G位点在3种山羊群体中为低度多态(PIC<0.25);KDM6A g.27177505C>A在济宁青山羊和辽宁绒山羊中为中度多态(0.25<PIC<0.5),在云上黑山羊中为低度多态(PIC<0.25).卡方适应性检验结果表明,EGR4 g.11028295G>A、g.11029053G>T和g.11029600T>A位点在3种山羊群体中均处于 Hardy-Weinberg 平衡状态(P>0.05);KDM4C g.37764228T>A、g.37767773T>A 和 g.37768026C>G 在3种山羊群体中均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);KDM6A g.27102554T>A和g.27177505C>A位点分别在辽宁绒山羊中和济宁青山羊中处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05),在云上黑山羊中处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05).关联分析结果表明,在云上黑山羊中EGR4 g.11029600T>A位点TT型的初生窝重和断奶窝重显著高于AA型(P<0.05);KDM4C g.37764228T>A位点TT和TA型的产羔数、初生窝重和断奶窝重显著高于AA型(P<0.05);KDM6A g.27177505C>A位点CC型产羔数显著高于CA型和AA型(P<0.05),g.27102554T>A位点TT型的初生窝重和断奶窝重显著高于AA型(P<0.05).综上所述,EGR4 g.11029600T>A、KDM4C g.37764228T>A 和 KDM6A g.27102554T>A 位点可作为云上黑山羊窝重选择的潜在分子标记;KDM4C g.37764228T>A和KDM6A g.27177505C>A位点可作为云上黑山羊产羔数选择的潜在分子标记.

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作者 李昆谕 [1] 刘玉芳 [2] 陶林 [3] 江炎庭 [4] 欧阳依娜 [4] 储明星 [3] 洪琼花 [4] 学术成果认领
分类号 S827.2
栏目名称 研究报告
DOI 10.16720/j.cnki.tcyj.2022.087
发布时间 2023-03-07
基金项目
云南省重大科技专项计划 现代农业产业技术体系 云南省万人计划产业技术领军人才项目 中国农业科学院科技创新工程 河北省自然科学基金青年项目
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