基于网络药理学和分子对接技术探究川芎抗肝纤维化的作用机制
Investigating the Mechanism of Chuanxiong Against Liver Fibrosis Based on Network Pharmacology and Molecular Docking Techniques
摘要为探究川芎抗肝纤维化的活性成分及作用机制.本研究采用网络药理学方法,采用GEO数据库及DisGeNET数据库检索获取肝纤维化靶点;利用TCMSP数据库及文献检索获取川芎化学成分及作用靶点;将川芎药物靶点与疾病靶点取交集,并进行蛋白互作网络构建及拓扑分析;采用DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析,利用微生信进行做图;通过Cytoscape软件构建"成分-靶点-信号通路"调控网络.采用分子对接技术针对川芎活性成分和关键靶点进行对接模拟.结果表明,TCMSP数据库检索结合文献研究,筛选得到川芎中8个活性成分及对应的88个作用靶点;GEO数据库筛选及DisGeNET数据库检索获取疾病靶点2 038个,交集得到32个川芎治疗肝纤维化的共同靶点,并筛选出转录激活因子3(Signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)、前列腺素内过氧化物合成酶 2(Recombinant prostaglandin endoperoxide synthase 2,PTGS2)和表皮生长因子受体(Epidermal growth factor receptor,EGFR)等关键靶点.富集分析表明,川芎治疗肝纤维化的靶点主要参与肝癌信号通路、脂质代谢和动脉粥样硬化、白介素17信号通路和内分泌抵抗等信号通路,涉及RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正向调节过程和信号转导过程等生物学过程."成分-靶点-信号通路"分析表明,川芎抗肝纤维化活性成分6个,分别为阿魏酸(Ferulic acid,FA)、川芎哚(Perlolyrine)、叶酸(Folic acid)、川芎萘呋内酯(Wallichilide)、亚麻油酸乙酯(Mandenol)和肉豆蔻酮(Myricanone),其中阿魏酸的节点度值最大.分子对接结果表明,川芎抗肝纤维化关键成分阿魏酸和关键靶点PTSG2、MMP9和EGFR分子均具有较好的结合能力,结合能分别为-23.04 kJ/mol、-22.17 kJ/mol和-25.14kJ/mol.川芎可通过靶向STAT3、PTGS2和EGFR等靶点,调控肝癌和脂质代谢等信号通路,改善肝纤维化病变,发挥保护肝脏的作用.
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