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小麦MYB转录因子家族的生物信息学分析

Bioinformatics analysis of the MYB transcription factors family in wheat

摘要为了探究MYB转录因子家族在小麦生长发育过程中的作用,利用小麦全基因组数据库和生物信息学软件对小麦中的MYB转录因子家族进行全基因组鉴定,分析了基因结构、顺式作用元件以及种内和种间的共线性.共鉴定出76个MYB转录因子,其中亲缘关系较近的MYB转录因子的基因结构和保守结构域基本一致.顺式作用元件分析结果表明,小麦中MYB转录因子家族包含多个顺式作用元件,如脱落酸、赤霉素、厌氧诱导、干旱诱导等相关元件,参与激素调控、逆境响应等生长发育过程.与大麦和二穗短柄草的种间共线性分析中,发现了28个在进化上更为保守的转录因子.种内的共线性分析发现53个基因呈现家族内共线性.

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分类号 Q945.8
栏目名称
DOI 10.19638/j.issn1671-1114.20210505
发布时间 2021-10-26(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
基金项目
国家自然科学基金资助项目(31071671); 天津市科技支撑项目(18YFZCNC01100,17JCZDJC34100)
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