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首页 > 天津师范大学学报（自然科学版） > 小麦AP2/ERF转录因子家族生物信息学分析

小麦AP2/ERF转录因子家族生物信息学分析

Bioinformatics analysis of TaAP2/ERF transcription factor family in wheat

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摘要为了探究AP2/ERF基因家族在小麦基因组中的分布及功能,利用生物信息学方法和小麦全基因组数据信息,在小麦全基因组范围内共鉴定出74个TaAP2/ERF转录因子基因.鉴定所得基因编码的蛋白大多数呈酸性,且大部分被定位在细胞核中,与多数转录因子蛋白相关报道一致.这些基因的启动子区包含多个应答植物激素和环境因子的顺式作用元件,如茉莉酸、脱落酸、光响应、厌氧和低温胁迫等.热图分析发现了6个在生物和非生物胁迫下特异表达的基因:AP2-S基因在非生物胁迫下特异表达;CBFIIId亚家族的3个基因(CBFIIId-B19、CB-FIIId-D19和CBFIIId-24.1)结构相同,在非生物胁迫下特异表达;CBFIVb-D21和CBF2基因能够对小麦的病原菌侵染作出响应.

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作者 卞云迪 [1] 张驰 [1] 王雪晴 [1] 杨晨晓 [1] 王光钰 [1] 刘晓颖 [1] 王颖 [2] 方芳 [2] 王振英 [1] 学术成果认领
作者单位 天津师范大学生命科学学院,天津 300387;天津市动植物抗性重点实验室,天津 300387 [1] 天津市宝坻区林业发展服务中心,天津 301899 [2]
关键词 小麦全基因组鉴定AP2/ERF转录因子家族基因结构表达分析
分类号 Q946（植物生物化学）
栏目名称
生命科学
DOI 10.19638/j.issn1671-1114.20220407
发布时间 2022-10-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（31071671） 天津市科技支撑项目（18YFZCNC01100） 天津市科技支撑项目（17JCZDJC34100）
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天津师范大学学报（自然科学版）

天津师范大学学报（自然科学版）

2022年42卷4期

39-45页

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