骨关节炎中自噬相关基因的鉴定及其靶向中药成分的筛选
Identification of autophagy-related genes in osteoarthritis and screening of targeted Chinese medicine components
摘要[目的]研究旨在鉴定骨关节炎(OA)中的自噬相关基因,并筛选其靶向中药成分.[方法]从基因表达综合数据库下载微阵列数据集GSE55235和GSE55457进行分析.分别筛选OA样本和健康对照样本之间的差异表达基因.然后分别对GSE55235和GSE55457数据集进行加权基因共表达网络分析,以获取OA中的枢纽基因模块和枢纽基因.将差异表达基因、枢纽基因和自噬相关基因取交集,获得OA中关键的自噬基因.使用微阵列数据集GSE12021验证关键的自噬基因的准确性.针对这些关键基因,筛选了一些中药成分,并进行分子对接验证.[结果]通过整合两个微阵列数据集中的差异表达基因、枢纽基因和自噬相关基因,最终获得了 OA中3个关键的自噬基因.微阵列数据集GSE12021的受试者工作特征曲线验证了关键的自噬基因的准确性.通过筛选靶向中药成分并进行分子对接验证,发现白藜芦醇和姜黄素与这些关键的自噬基因均表现出较强的结合活性.[结论]研究发现3个可作为OA诊断标志物和治疗靶点的关键自噬基因.此外,白藜芦醇和姜黄素是治疗OA的潜在中药成分.
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