换一批庆大霉素致大鼠耳蜗氧化损伤的差异基因表达谱分析
Analysis of Differential Gene Expression Profile of Gentamicin-Induced Oxidative Damage in Rat Cochlea
摘要目的 研究庆大霉素损伤后耳蜗的顶、中和底回中与氧化应激相关的基因表达谱,以期筛选防治药物性聋的候选基因.方法 选取P2 SD大鼠15只,分离基底膜,将基底膜分为对照组与实验组,每组15条基底膜;实验组使用0.6 m M庆大霉素培养24小时,对照组使用等量PBS培养24小时;每组5条基底膜分别进行免疫荧光染色和毛细胞计数,对照组与实验组各10条基底膜,分为顶、中和底回各三组,提取RNA,利用RT2 ProfilerTM PCR阵列筛选六组与氧化损伤相关的84个基因的表达差异,并对差异基因进行GO分析和相互作用网络分析;利用RT-PCR对候选基因进行验证.结果 实验组庆大霉素损伤后,毛细胞数量减少,且中回和底回的毛细胞数量显著少于顶回;与对照组相比,实验组中84个氧化损伤相关的基因中,顶回共有14个基因表达有生物学意义,其中12个基因表达上调,2个基因表达下调;中回共有19个基因表达有生物学意义,其中5个基因表达上调,14个基因表达下调;底回共有10个基因表达有生物学意义,其中5个基因表达上调,5个基因表达下调;其中H mo x1、Ptgs2、A poe、Gpx6四个基因在庆大霉素损伤后差异倍数从顶回到底回逐渐减小.蛋白互作分析显示Hmox1是具有最高连接度的关键基因,与9个基因相互作用.RT-PCR验证显示H mox1基因表达量在庆大霉素损伤后沿耳蜗纵轴差异倍数逐渐减小.结论 庆大霉素损伤过程中,H mo x1可能通过上调其在基底膜顶回的表达起到保护作用,H mo x1可作为庆大霉素损伤中起保护作用的关键候选基因进行深入研究.
更多相关知识
分类号
R
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1006-7299.2022.04.016
发布时间
2022-07-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家重点基础研究发展计划（973计划）（2014CB541700）；
国家自然科学基金（81870732）；
国家自然科学基金（81670924）；
陕西省科技重点项目（2018PT-01）；
陕西省科技重点项目（2017ZDXM-SF-061）；
西京助推-先进学科建设项目（XJZT14X07）；
西京助推-先进学科建设项目（XJZT18ML18）；
西京助推-先进学科建设项目（XJZT19MDT02）
- 浏览88
- 被引1
- 下载7
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
