滇龙胆草中香叶醇10-羟化酶基因的克隆、蛋白结构及表达分析
Cloning,protein structure,and expression analysis of geraniol 10-hydroxylase gene from Gentiana rigescens
摘要本研究基于滇龙胆草转录组数据分析,使用RT-PCR技术克隆获得两条香叶醇10-羟化酶基因,命名为GrG10H1和GrG10H2.使用在线软件对其进行了生物信息学分析,两条基因全长分别为1 548 bp、1 482 bp.系统进化分析显示该基因与细胞色素P450家族中CYP76B亚家族亲缘关系最近.通过对该蛋白进行三维结构预测、同源模建和分子对接,分析了 GrG10H蛋白活性口袋中可能参与催化功能发挥的关键氨基酸残基.荧光定量PCR表明GrG10H1基因在叶中表达水平最高,茎次之,根最低.而GrG10H2基因在根和叶中表达水平较高,在茎中几乎不表达.本研究还建立了能够生产龙胆苦苷的愈伤组织细胞培养体系,为进一步解析龙胆苦苷生物合成机制奠定了基础.
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