摘要为探究有机肥沼液提升蒙古黄芪品质的分子机理,本研究以一年生蒙古黄芪为材料,利用大田试验,优选沼液处理(biogas slurry,BS),以常规化肥(conventional fertilizer,CF)和清水处理(clear water treatment,CK)为对照,考察不同处理方式对收获期蒙古黄芪生物量、生理特性及根总黄酮(total flavonoids,TAF)、总皂苷(total saponins,TANS)含量的影响,并对3种处理方式下的蒙古黄芪根进行转录组学分析.结果表明,相比CK、CF处理,BS处理可显著增加蒙古黄芪的株高(plant height,PH)及根干重(root dry weight,DWT),提高过氧化物酶(peroxidase,POD)、过氧化氢酶(catalase,CAT)、抗坏血酸过氧化物酶(ascorbic acid peroxidase,APX)活性及游离脯氨酸(free proline,Pro)、可溶性糖(soluble sugar,SS)、可溶性蛋白(soluble protein,SP)的含量,促进其有效成分TAF、TANS含量的积累.转录组分析表明,BS与CK处理组的差异表达基因(differentially expression genes,DEGs)达1 755个,与CF处理的DEGs为519个,其调控蒙古黄芪品质的差异基因主要富集在类黄酮、萜类、2-羟基异黄酮还原酶、苯丙烷生物合成等生物学过程,以及淀粉、蔗糖代谢、氧化还原活性、植物激素信号传导途径等有关的分子功能,且每个途径中相关DEGs多数以上调为主.其中APF7、WRKY44、GGT3、CHS、HMGS、UGT73C5可能是沼液提升蒙古黄芪品质的关键调控基因.相关性分析表明,CHS、HMGS、ARF7、WRK44 与 APX、CAT、TAF、SP、POD、SS、UGT73C5 间、UGT73C5 与 DWT 间分别存在极显著正相关关系.研究表明沼液可通过调控蒙古黄芪生物量、生理特性及有效成分生物合成相关基因表达,影响其品质.