换一批基于生物信息学对比分析高脂饮食和蛋氨酸胆碱缺乏饮食构建的非酒精性脂肪性肝病小鼠模型
The non-alcoholic fatty liver model was compared between high-fat diet and methio-nine choline deficiency diet based on bioinformatics
摘要目的 比较高脂饮食(high-fat diet,HFD)饮食和蛋氨酸胆碱缺乏(methionine-choline-deficient,MCD)饮食对 C57 小鼠非酒精性脂肪性肝病(non-alcoholic fatty liver disease,NAFLD)模型的影响,通过生物信息学方法揭示其差异表达基因(GEO-data-based analysis of differentially expressed genes,DEGs)并进行功能分析.方法 从 GEO 数据库中获取 GSE78170、GSE123354 的表达数据.使用 R语言分别比较 C57 小鼠对照组与 MCD饮食组、C57 小鼠对照组与 HFD饮食组数据获得 DEGs.对 DEGs进行进一步的差异分析、功能富集分析、构建基因和蛋白互作网络及重叠 DEGs 对比分析.结果 筛选出 HFD 诱导的上调基因 44 个,下调基因 16个;MCD诱导的上调基因 43 个,下调基因 73 个;分析富集分析排名前 12 位的生物学过程,提示 HFD 与肝脏单纯脂肪积累相关,MCD则能全方位促进 NAFL进一步转变为 NASH.结论 HFD诱导的基因主要涉及肝脏脂肪积累,而 MCD 更倾向于全方位促进NAFL向 NASH的进展.
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关键词
非酒精性脂肪性肝病蛋氨酸胆碱缺乏高脂饮食生物信息学分析Non-alcoholic fatty liver diseaseMethionine-choline-deficientHigh-fat dietBioinformatics analysis
分类号
R575（消化系及腹部疾病）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1006-5709.2024.02.003
发布时间
2024-03-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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