换一批摘要目的 基于 LC-MS/MS非标记定量蛋白质组学分析结直肠癌(colorectal cancer,CRC)差异蛋白并筛选与 CRC 发生相关的关键通路.方法 采用LC-MS/MS对 3 例CRC患者肿瘤组织和癌旁正常组织的蛋白质组进行定量分析,筛选差异蛋白.通过生物信息学分析筛选与 CRC发生发展密切相关的候选蛋白并验证.通过 TCGA分析筛选 CRC潜在标志物.结果 蛋白质组学分析共鉴定了 4 257 个蛋白,差异蛋白 544 个,显著上调蛋白 446 个,显著下调蛋白 98 个.基于GO富集分析及KEGG通路分析,发现与RNA和 DNA功能相关的蛋白通过调控基因表达和细胞增殖参与了 CRC的发生发展.基于此筛选 RNA 功能相关差异蛋白为候选蛋白:PRPF19、HNRNPM、UTP18、RCL1、RPL3、EIF5、NCBP2、NOP58、RANBP2,随后在另外 5 例 CRC 患者肿瘤组织和癌旁组织上进行了表达验证.成功验证出 NCBP2、PRPF19、HNRNPM 在 CRC中表达显著增加,且 NCBP2 表达水平与患者总体生存率呈负相关.结论 本研究筛选了在 CRC发生发展过程中具有潜在重要作用的 3 个差异蛋白,有望作为 CRC诊断和治疗的靶标.
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分类号
R735.3（消化系肿瘤）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1006-5709.2024.10.010
发布时间
2024-10-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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