换一批
换一批通过RNA-seq探究外源性硫化氢对肝癌细胞系HepG2的影响
Exploring the effects of exogenous hydrogen sulfide on hepatoma cell line HepG2 by RNA-seq
摘要目的 探究外源性硫化氢(hydrogen sulfide,H2S)对肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的影响及可能的分子机制,为HCC诊疗提供理论实验支持.方法 从GEO数据库中获取HCC的基因表达数据,并筛选外源性H2S处理HepG2细胞的RNA-seq数据,通过差异基因筛选、GO和KEGG通路分析,确定H2S调控的主要生物学功能和信号通路.结果 数据分析表明,与正常组织相比,肝癌组织中硫化氢合成关键酶胱硫醚γ裂解酶(cystathionine γ-lyase,CSE)和胱硫醚合成酶(cystathionine β-synthase,CBS)的表达显著下降.筛选出3 640个差异基因,其中317个与细胞衰老、580个与细胞增殖、43个与凋亡相关.通过蛋白互作网络分析,Jun、MAPK1和MAPK3等关键基因被识别,提示H2S可能通过调控Jun/MAPK信号通路影响HCC的发生发展.结论 H2S在HCC中可能通过Jun/MAPK通路发挥的调控作用,为H2S在HCC中的分子机制研究和潜在治疗应用提供了基础.
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