换一批基底膜相关基因在结肠癌患者的临床预后风险评分和免疫特征
Clinical prognostic risk score and immune profile of basement membrane-associated genes in patients with colon cancer
摘要目的 探讨基底膜相关基因(basement membrane related genes,BMRGs)在结肠癌的临床预后和免疫特征.方法 从文献中收集了222个BMRGs,在TCGA队列应用LASSO-Cox回归方法建立风险评分模型,并使用GSE87211队列验证.此外,构建包含BMRGs风险评分和临床因素的列线图预测结肠癌患者的生存预后.最后,评估风险评分亚组的蛋白功能富集状态、免疫浸润水平、药物敏感性分析和单细胞表达情况.结果 9个BMRGs构建的风险亚组与结肠癌患者的预后高度相关(P＜0.001).其中ADAMTS4、GPC2、UNC5A、ITGA7、LAMA2、PODN 是预后不佳因素,ADAMTS8、UNC5D、MMP1是预后保护因素.整合BMRGs风险评分、TNM肿瘤分期和患者年龄的列线图有助于提高预后不良患者的识别效率.蛋白功能分析显示高风险组的上调基因富集于Hedgehog信号通路并参与上皮-间充质转化;相较于高风险组,低风险组免疫细胞浸润程度更高;药物敏感性分析显示,高风险组患者对AZD7762、Wee1激酶抑制剂的敏感性较高;低风险组患者对SB505124的敏感性较高;单细胞分析显示:GPC2、ADAMTS4、PODN、LAMA2、ITGA7基因在结肠癌的肿瘤细胞中均存在高表达.结论 本研究建立并验证了基于BMRGs的风险评分模型,为预测结肠癌患者的预后状态提供了一项有效的临床参考指标.
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关键词
基底膜相关基因结肠癌预后模型列线图生物信息学Basement membrane-related genesColon cancerPrognosis modelNomogramBioinformatic
分类号
R735.3（消化系肿瘤）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1006-5709.2025.04.015
发布时间
2025-06-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（82102805）
湖南省自然科学基金项目（2024JJ7594）
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