宏基因二代测序在终末期肝病合并肺部感染病原学诊断的价值
Value of metagenomics next-generation sequencing in etiological diagnosis of end-stage liver disease complicated with pulmonary infection
摘要目的 探讨宏基因二代测序(metagenomics next-generation sequencing,mNGS)技术在终末期肝病(end-stage liver disease,ESLD)合并肺部感染病原学诊断中的应用价值.方法 收集 2022 年 1 月至 2024 年 8 月在我院确诊为 ESLD合并肺部感染患者 86例的临床资料,男 59 例,女 27 例,年龄(62.50±15.50)岁.纳入研究的 86 例患者中,有 80 例确定病原学,按照感染程度将患者分为重症组(n=42)和非重症组(n=38),并采用 SPSS 23.0 统计软件进行数据统计分析.结果(1)传统病原学检测结果,细菌方面共检测出 8 种菌属,真菌中只检测出 1 种菌属.(2)mNGS检测结果,细菌方面共检测出 17 种菌属,真菌方面共检测出 3 种菌属,特殊病原体方面共检测出 2 种菌属,病毒方面共检测出 4 种菌属.(3)mNGS 检测的阳性率显著高于其他检测方法(P<0.05).(4)mNGS与传统病原体培养检测、PCR检测、总体传统微生物检测相比临床诊断结果一致性较高.(5)对重症和非重症患者的临床特征进行比较,结果发现,两组患者在性别、白细胞计数、中粒细胞百分比、中粒细胞计数、血小板计数、C 反应蛋白、谷丙转氨酶、谷草转氨酶、尿素氮、肌酐比较,差异均有统计学意义(P<0.05).(6)两组患者在单纯感染和混合感染比较,差异均有统计学意义(P<0.05).在混合感染中,细菌病毒真菌混合感染在重症患者中的比例显著高于非重症患者(P<0.05).(7)42 例重症患者在细菌属水平共检测出 17 种,真菌属水平检出 3 种,病毒检测出 4 种.细菌类病原菌中,假单胞菌属、克雷伯氏菌属和不动杆菌属最为常见,占比分别为 42.86%、38.10%、33.33%;真菌类病原菌中,曲霉属和肺孢子菌属占比较高,占比分别为 30.95%、16.67%;病毒类病原菌中,淋巴隐病毒属和玫瑰疹病毒属较为常见,占比分别为 26.19%、21.43%.(8)确定病原体的 80 例患者,增加抗生素种类的患者为 21 例(48.83%)、更换抗生素种类 6 例(13.95%)、抗生素选用未做调整 16 例(37.21%).临床结局中,重症组好转 14 例,病情恶化(死亡及因病危自动出院)12 例,非重症组好转出院 15 例,病情恶化 2 例.结论 mNGS方法检测所需时间较少、阳性率较高,且在 ESLD合并感染病原学诊断中具有较高的敏感性和准确性,展现出重要的临床应用价值.
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