基于MSAP和SSR标记的高粱甲基化连锁群LGC、LGD的构建

Construction of methylation linkage groups LGC and LGD with MSAP and SSRmarkers inSorghum bicolor (L.) Moench

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摘要以高粱(Sorghum bicolor (L.) Moench)品种'B2V4'和'1383-2'杂交获得的F2群体为材料,通过SSR和MSAP标记检测高粱基因组差异,构建其甲基化遗传连锁群.结果显示,高粱甲基化连锁群LGC含有3个SSR标记和23个甲基化标记,覆盖高粱基因组44.3 cM;甲基化连锁群LGD含有4个SSR标记和8个甲基化标记,覆盖高粱基因组46.2 cM.LGC上甲基化位点仅来源于EcoRⅠ/MspⅠ酶切组合,而LGD上有来源于EcoRⅠ/MspⅠ和EcoRⅠ/HpaⅡ两种酶切组合的甲基化位点.在LGC连锁群Xtxp69附近检测到一个密集的甲基化位点区域.研究结果表明MSAP标记可以快速检测植物基因组甲基化差异,适用于构建甲基化连锁群.

作者段永红 ^[1] 张旭 ^[2] 柳青山 ^[2] 孙毅 ^[3] 学术成果认领

作者单位山西省农业科学院高粱研究所, 高粱遗传与种质创新山西省重点实验室, 山西晋中 030600;山西农业大学农学院, 山西太谷030801 ^[1] 山西省农业科学院高粱研究所, 高粱遗传与种质创新山西省重点实验室, 山西晋中 030600 ^[2] 山西省农业科学院生物技术研究中心, 太原 030031;农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室, 太原 030031 ^[3]

关键词高粱 SSR MSAP 甲基化 Sorghum bicolor SSR MSAP DNA methylation

主题词甲基化(Methylation)基因组(Genome)比沙可啶(Bisacodyl)基因连锁(Genetic Linkage)研究(Research)

分类号 Q943.2

栏目名称

遗传与育种

DOI 10.11913/PSJ.2095-0837.2018.20237

发布时间 2018-08-27

基金项目

山西省重点实验室开放课题（2015K-03）；山西省自然科学基金项目（201701D121105）；山西省财政支农项目(2015TGSF-10)。This work was supported by grants from the Key Laboratory Innovation of Shanxi Province（2015K-03）； Natural Science Foundation of Shanxi Province（201701D121105）； Supporting Agriculture Project from Department of Finance of Shanxi Province（2015TGSF-10）