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兰州百合LdGRAS基因家族的鉴定和表达分析

Genome-wide identification and expression analysis of the LdGRAS gene family

摘要百合(Lilium)鳞茎需要经过低温打破休眠,实现正常生长和开花.本研究通过兰州百合(L.davidii var.unicolor(Hoog)Cotton)全基因组序列分析,鉴定该物种的LdGRAS基因家族,结合生物信息学、转录组数据和RT-qPCR分析结果,筛选可能参与百合鳞茎休眠解除过程的候选基因.结果显示,在兰州百合中共鉴定出52个LdGRAS基因,可分为9个进化分支,各亚族内基因结构和保守基序具有高度的一致性;Ld-GRAS 基因家族与油棕(Elaeis guineensis Jacq.)、海枣(Phoenix dactylifera L.)分别存在29和38对共线性基因对;LdGRAS基因启动子区包含与光响应、组织发育和胁迫响应相关的多种顺式作用元件,其中只有LdGRAS25启动子含有细胞周期相关调控元件.转录组数据分析结果表明,LdGRAS基因家族在兰州百合的根系和子房中高表达基因最丰富.RT-qPCR分析结果显示,LdGRAS25基因在低温贮藏鳞茎茎尖中的表达量显著高于常温处理组,其编码的蛋白定位于细胞核中.综上,LdGRAS家族基因在兰州百合不同组织的表达具有一定特异性,其中LdGRAS25在休眠解除过程中响应低温上调表达,可作为休眠解除研究的候选基因.

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植物科学学报

植物科学学报

2025年43卷6期

758-769页

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