胆囊癌差异蛋白质组学分析

Differential proteomic analysis of gallbladder cancer

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摘要目的运用蛋白质组学经典技术,双向凝胶电泳、质谱鉴定及生物信息学分析在胆囊癌组、正常胆囊对照组中寻找差异蛋白,发现和鉴定胆囊癌相关的肿瘤标志物及潜在的治疗靶点.方法标本分两组:胆囊癌组-胆囊癌组标本59 例;正常对照组-胆囊癌癌旁组织标本 59 例.组织样品通过洗涤、裂解、离心收集总蛋白样本,分装冻存.经过第一向等点聚焦、第二向SDS-PAGE电泳,凝胶经考马斯亮蓝染色显色后,用Gs-800 光密度仪获得凝胶图像.经PD-Quest凝胶图像分析软件进行分析后,找出有差异的蛋白点.通过蛋白指纹谱鉴定(PMF),基质辅助激光解吸附质谱技术(MALDI-TOF)获得差异蛋白碎片的二级质谱,利用Biotools软件采集肽碎片质荷比信息;利用Mascot搜索引擎对数据库进行检索,鉴定差异蛋白质的氨基酸序列,获得相应特异蛋白质信息.结果发现 66 个差异表达蛋白.其中在胆囊癌中上调表达蛋白 21 个,下调表达蛋白 45 个.21 个差异蛋白得分大于 56,在胆囊癌中上调表达的 10 个,下调表达的 11 个.主要包括膜联蛋白、膜突蛋白、热休克蛋白、波形蛋白、视黄醛脱氢酶 1、半乳凝素等.结论上述蛋白可能在肿瘤的发生发展机制中起着重要的作用,是诊断、治疗的潜在靶点,值得后续进一步研究.