禽流感病毒HA蛋白与人受体的分子对接

Molecular Docking of Human-Like Receptor to Hemagglutinins of Avian Influenza A Viruses

二维码有效期 120s

摘要血凝素(hemagglutinin,HA)是位于禽流感病毒表面的糖蛋白.在病毒感染过程中,HA与禽类宿主细胞表面受体结合,介导病毒膜与宿主核内体膜的融合,在传染过程中发挥关键作用.自然界中的禽流感病毒处于不断演化之中,其HA的禽受体结合位点常常发生氨基酸变异.因此,当HA变异体与人受体结合能力较强时,禽流感病毒往往会发生跨种传播而感染人.为预防禽流感的跨种传播,人们迫切需要发展大规模快速检测或预测HA变异体与人受体结合亲和力的方法,以评估各种新发禽流感病毒的跨种传播能力,提前筛选出有潜在危险的病毒株.针对此问题,本研究以H7N9亚型的HA蛋白H7为研究对象,发展了一种运用分子对接的计算方法,预测HA变异体与人受体的结合亲和力.该方法的计算结果表明,H7与人受体的结合亲和力普遍弱于有较强传染人能力的H1,说明H7N9亚型病毒的跨种传播能力普遍较弱;但是,计算分析也揭示,部分新发的H7N9毒株的HA有强的人受体结合亲和力,提示在自然演化过程中,H7N9病毒有可能演化出具有较强的感染人能力的新毒株,这与2013年禽流感疫情的实际发生情况相一致.因此,本文所发展的计算方法可用于快速预测新发禽流感病毒HA与人受体的结合亲和力,为新发禽流感病毒的跨种传播风险评估提供理论依据.

作者邓迎春 ^[1] 柳青 ^[1] 黄强 ^[1] 学术成果认领

作者单位复旦大学生命科学学院,上海,200438 ^[1]

关键词禽流感病毒跨种传播受体结合特异性分子对接结合自由能 Influenza A virus Interspecies transmission Receptor-specificity Molecular docking Binding free energy

分类号 O641

栏目名称论文

DOI 10.3866/PKU.WHXB201612052

发布时间 2017-04-17

基金项目

The project was supported by the National Natural Science Foundation of China Special Program for Applied Research on Super Computation of the NSFC-Guangdong Joint Fund China.国家自然科学基金 NSFC-广东联合基金(第二期)超级计算科学应用研究专项和国家超级计算广州中心支持资助项目