换一批大肠杆菌和志贺氏菌O-抗原糖基转移酶与聚合酶的生物信息学研究
Computing Analysis of Glycosyltransferases and Polymerases Involved in O-antigen Biosynthesis of Escherichia coli and Shigella
摘要利用生物信息学手段对大肠杆菌和志贺氏菌的110个O-抗原糖基转移酶与39个O-抗原聚合酶的序列进行分析,探讨这两种酶的序列和结构特点.统计了其序列一致性,密码子使用和(G+C)%含量的特点;讨论了O-抗原糖基转移酶和聚合酶对底物的特异性;推测了6组糖基转移酶的功能;通过对蛋白拓扑结构的预测,发现O-抗原聚合酶中广泛存在一个位于细胞周质中的亲水环(Loop),是可能的功能区域;通过对蛋白高级结构的预测,发现O-抗原糖基转移酶属于两个不同的蛋白超家族.
更多相关知识
医学主题词
抗原(Antigens)肿瘤转移(Neoplasm Metastasis)聚合(Polymerization)大肠杆菌(Escherichia coli)计算生物学(Computational Biology)
分类号
Q93（微生物学）
栏目名称
DOI
10.3321/j.issn:0001-6209.2004.03.017
发布时间
2004-07-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家高技术研究发展计划（863计划）（2002AA2Z2051）
国家自然科学基金（30125001）
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