换一批拟诺卡氏菌16S rRNA,gyrB,sod和rpoB基因的系统发育分析
Phylogenetic analysis of Nocardiopsis species based on 16S rRNA,gyrB, sod and rpoB gene sequences
摘要为了更好地了解拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis)各物种间的系统发育关系,该属现有有效描述种的gyrB,sod和rpoB基因的部分序列被测定,结合16S rRNA基因,对拟诺卡氏菌属进行了系统发育重建.研究发现拟诺卡氏菌属gyrB,sod和rpoB基因的平均相似性分别为87.7%、87.3%和94.1%,而16S rRNA基因的平均相似性则达到96.65%,3个看家基因均比16S rRNA具有更高的分歧度.比较基于不同基因的系统树发现,由gyrB基因得到的系统树拓扑结构与16S rRNA得到的结构在亚群上基本一致.因此,gyrB基因在拟诺卡氏菌属的系统分类上比16S rRNA基因更具优越性.
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DOI
10.3321/j.issn:0001-6209.2007.06.002
发布时间
2008-01-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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