换一批不同温度条件下副溶血性弧菌tdh基因表达及其代谢组响应
Metabolome response to tdh expression of pathogenic Vibrio parahaemolyticus induced by different temperatures
摘要[目的]采用RT-PCR的方法分析致病性副溶血性弧菌毒力基因表达,并应用代谢组学的方法研究毒力基因不同表达水平下致病性副溶血性弧菌代谢组的响应.[方法]本文以致病性副溶血性弧菌(Vibrio parahaemolyticus)ATCC33846为材料,分别提取不同温度(4、25和37℃)下菌体总RNA和代谢组.采用相对定量的方法检测副溶血性弧菌tdh基因在不同温度条件下的表达差异,同时应用超高压液相色谱-四级杆飞行时间质谱联用仪(UPLC/Q-TOF-MS)系统为工作平台检测其代谢组.采用主成分分析法(principal .omponent analysis,PCA)比较副溶血性弧菌代谢组轮廓差异,并通过皮尔森和斯皮尔曼相关性分析法分析代谢组与tdh基因表达之间相关性.[结果]结果表明,不同温度条件下tdh基因表达强弱的排列顺序25℃＞4℃＞37℃;在tdh基因不同表达水平下发生显著性(P＜0.05)变化的主要代谢物是有机酸、氨基酸、醇、酮、酯;共得到11种代谢物与tdh基因表达高度相关(相关性系数|r|=1,P＜0.05),其中3种为负相关,8种为正相关,且醇类代谢物与tdh基因表达的正相关性最显著.[结论]本研究发现副溶血性弧菌代谢组与毒力基因表达存在一定的相关性,有望为副溶血性弧菌致病机理的深入探究提供一定的理论支持.
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关键词
副溶血性弧菌(Vibrio parahaemolyticus)毒力基因表达代谢组轮廓相关性分析Vibrio parahaemolyticus virulence gene expression metabolic profiling correlation analysis
分类号
Q935（微生物生理学）
栏目名称
DOI
10.13343/j.cnki.wsxb.2014.08.005
发布时间
2014-09-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金面上项目（(31271870)）
上海市科委部分地方院校能力建设项目（(11310501100)）
上海市科委工程中心建设项目（(11DZ2280300)）
上海市科委科技创新行动计划项目（(12391901300)）
上海市科技兴农重点攻关项目（(沪农科字2014年3-5号)）
Supported by the National Natural Science Foundation of China （(31271870),by the Project of Science and Technology Commission of Shanghai Municipality (11310501100,12391901300)）
by the Shanghai Engineering Research Center of Aquatic-Product Processing & Preservation （(11DZ2280300) and by the Key Project of Shanghai Agriculture Prosperity through Science and Technology (2014,3-5)）
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