换一批苏云金芽胞杆菌转录调控因子CodY的体外靶基因的筛选
Genome-wide identification of CodY target genes in Bacillus thuringiensis by in vitro binding analysis
摘要[目的]利用Avi-tag和Pull down技术建立体外靶基因筛选的新方法,在苏云金芽胞杆菌YBT-1520基因组范围内进行体外高通量筛选转录调控因子CodY的靶基因,为深入研究CodY在苏云金芽胞杆菌中的功能及调控网络打下基础.[方法]用Avi-tag技术对CodY蛋白进行体外生物素标记,酶切苏云金芽胞杆菌YBT-1520总DNA并在两端加上便于测序的adapter序列,用链霉亲和素树脂筛选与CodY蛋白相互作用的靶基因.[结果]在苏云金芽胞杆菌中得到了46条CodY可以直接作用的靶序列,分析发现CodY在苏云金芽胞杆菌中主要调控氨基酸代谢、糖代谢、脂肪酸代谢、转运、调控、DNA修复、双组份调控等的转录.[结论]本研究采用的Avi-tag技术具有特异性强、操作简单、成本低等优势,为转录因子体外靶序列的高通量筛选提供新的方法;苏云金芽胞杆菌中CodY靶基因的筛选为其他微生物中CodY的功能研究打下基础.
更多相关知识
关键词
CodY靶基因Avi-tag技术苏云金芽胞杆菌生物素调控CodYtarget genesAvi-tag technologyBacillus thuringiensisbiotinregulation
栏目名称
DOI
10.13343/j.cnki.wsxb.20150477
发布时间
2016-07-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（(30900016)）
湖北省自然科学基金（(2014CFB931)）
Supported by the National Natural Science Foundation of China （(30900016) and by the Natural Science Foundation of Hubei Province of China (2014CFB931)）
- 浏览87
- 被引1
- 下载0
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
