换一批ICNP与SeqCode:组学时代原核生物命名面临的机遇与挑战
ICNP and SeqCode:opportunities and challenges of prokaryotic nomenclature in the omics era
摘要自1936年细菌学家Buchanan负责起草专门的细菌命名法规以来,国际原核生物命名法规(International Code of Nomenclature of Prokaryotes,ICNP)在不断发展和完善过程中,积极促进了原核生物分类学及相关学科的发展.随着组学技术在原核生物多样性研究中的应用,越来越多未培养的细菌和古菌新类群被发现,却因为ICNP要求活的生物材料作为命名模式(nomenclatural type),而无法获得生效名称(validly published name).2022年,原核生物命名法规从序列数据描述原核生物命名法(Code of Nomenclature of Prokaryotes Described from Sequence Data,SeqCode)正式发布,以补充ICNP在未培养微生物类群命名方面的不足.SeqCode不希望和ICNP产生较大分歧,并尽可能保留在将来和ICNP合并的可能性.然而,作为两种独立运行的命名法规,尚不明确SeqCode和ICNP并存会对学术界产生怎样的影响.本文系统介绍了 ICNP和SeqCode各自的发展历程和主要内容,分析了二者的优势和局限性,并呼吁微生物学相关领域的学者共同关注原核生物命名法规并应用于实践,以期构建更加合理、有效的原核生物名称系统.
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关键词
从序列数据描述原核生物命名法(SeqCode)国际原核生物命名法规(ICNP)命名模式未培养原核生物分类学Code of Nomenclature of Prokaryotes Described from Sequence Data(SeqCode)International Code of Nomenclature of Prokaryotes(ICNP)nomenclatural typeuncultured prokaryotetaxonomy
栏目名称
DOI
10.13343/j.cnki.wsxb.20240011
发布时间
2024-11-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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