换一批基于CRISPR/Cas13a的马尔堡病毒核酸检测方法的建立
A CRISPR/Cas13a-based nucleic acid detection method for Marburg virus
摘要[目的]建立一种基于成簇的规律间隔短回文重复序列及其相关蛋白13a(clustered regularly interspaced short palindromic repeats/associated protein 13a,CRISPR/Cas13a),针对马尔堡病毒核酸的快速检测方法.[方法]根据马尔堡病毒核蛋白(nucleoprotein,NP)基因保守区序列设计合成特异性的逆转录酶重组酶介导链替换核酸扩增(reverse transcription recombinase aided amplification,RT-RAA)引物及CRISPR RNA(crRNA),利用RT-RAA等温扩增技术对靶序列进行扩增,通过CRISPR/Cas13a系统检测扩增产物,并结合消线法(easy-readout and sensitive enhanced,ERASE)侧流层析试纸进行结果判读.最后利用国家标准品对建立的新方法的灵敏度和特异性进行评估.[结果]筛选出一组针对马尔堡病毒NP基因的高效扩增引物和crRNA,建立了用于马尔堡病毒检测的CRISPR-ERASE方法,可在1 h内检测出浓度为1 copy/μL目标核酸,并与其他多种病原体无交叉反应.[结论]本研究基于CRISPR/Cas13a建立了一种快速、简便、高灵敏度和高特异性的马尔堡病毒核酸检测方法.
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关键词
马尔堡病毒CRISPR/Cas13a核酸检测逆转录酶重组酶介导链替换核酸扩增(RT-RAA)Marburg virusCRISPR/Casl3anucleic acid detectionreverse transcription recombinase-aided amplification(RT-RAA)
栏目名称
DOI
10.13343/j.cnki.wsxb.20240076
发布时间
2024-11-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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