摘要蓝细菌(cyanobacteria),俗称蓝藻,是水生生态系统中重要的初级生产者,也是常见的水华优势藻.噬藻体(cyanophage),尤其是原噬藻体(prophage)是重要的浮游生态因子,影响蓝藻的进化和水生微生物群落结构.然而,有关原噬藻体的信息极为有限,迄今尚未有关于微囊藻(Microcystis)原噬藻体的研究报道.[目的]探讨微囊藻的溶原性及其原噬藻体的基因组特征.[方法]从NCBI数据库中下载了所有微囊藻基因组(共计 354 个)序列,利用PHASTER软件预测其携带的原噬藻体,并分析原噬藻体的携带率、基因组大小和G+C含量;通过毒力因子数据库(virulence factors of bacterial pathogens,VFDB)和综合抗生素研究数据库(comprehensive antibiotic resistance database,CARD)平台,分析完整型原噬藻体与疑似型原噬藻体中携带的耐药因子与毒力因子;综合运用生物信息学工具对完整型原噬藻体和疑似型原噬藻体进行基因功能注释和系统进化分析.选取含有完整型原噬藻体的水华微囊藻(Microcystis aeruginosa)FACHB-1326,用丝裂霉素C进行原噬藻体活化诱导,并采用点斑法进一步验证活化噬藻体的感染活性.[结果]在全部354 个微囊藻基因组中,98.3%的藻株被预测出携带原噬藻体或原噬藻体样片段;共发现完整型原噬藻体 13 个,疑似型原噬藻体 5 个,不完整型原噬藻体 725 个.将完整型原噬藻体和疑似型原噬藻体分别命名为WZ1-WZ13 和YS1-YS5.在其基因组中均未发现耐药因子与毒力因子基因.蛋白谱发育树(phylogenomic tree)显示,这 18 株微囊藻原噬藻体与其他已知病毒的进化距离较远.生物信息学分析提示,YS5 揭示了一个以往未知的新属;WZ2、WZ3、WZ4、WZ5、WZ6、WZ7、WZ9、WZ10、WZ11、WZ12 与 YS3 共同揭示了一个以往未知的新科;WZ1 与YS1 共同揭示了一个新科;YS2、YS4、WZ8 和WZ13 则各自揭示了一个新科.FACHB-1344 和FACHB-1326 各被预测出一个完整型原噬藻体,试验表明丝裂霉素C可成功将其诱导活化.[结论]溶原现象在微囊藻中普遍存在,微囊藻基因组中整合的原噬藻体代表了以往未知的病毒进化谱系.本研究拓宽了对浮游病毒的认知.