换一批
换一批摘要目的 对水痘-带状疱疹病毒(varicella-zoster virus, VZV)Oka株和84-7株的部分基因特征进行分析,为建立Oka株和84-7株的鉴别方法提供依据. 方法 利用PCR技术扩增相关基因,并运用生物信息学软件对水痘-带状疱疹病毒OKa株和84-7株的PstI酶切位点、抗原蛋白基因序列(ORF14,ORF68)、高突变区域(ORF62)及84-7株复制起点进行序列比较和分析.结果 Oka株酶切位点特征为PstI-SmaI+BssHII+ NaeI+,84-7株的酶切位点特征为PstI+SmaI-BssHII- NaeI-;Oka株和84-7株ORF14编码的蛋白质同源性为99.8%,3个碱基的差异导致了3个氨基酸的变化,且这两株病毒株的R2可变区的串联重复单位拷贝数均为7;Oka株和84-7株ORF68编码的蛋白质同源性为100%,且存在2个低复杂性区域(LCR);ORF62编码区蛋白质的同源性为99.2%,具有14个低复杂性区域;84-7株复制起点区域包含一个13TA+19GA结构. 结论 Oka株和84-7株的同源性很高,但在酶切位点方面存在差异,可用于Oka株和84-7株的鉴别,为今后确立水痘-带状疱疹病毒毒株的鉴别方法提供依据.
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关键词
水痘-带状疱疹病毒Oka株84-7株酶切位点基因特征同源性Varicella-zoster virus (VZV)Oka strain84-7 strainRestriction fragmentGenetic characteristicsHomology
分类号
R373.1+2
栏目名称
DOI
10.13309/j.cnki.pmi.2017.01.006
发布时间
2017-05-08
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