换一批孟德尔随机化分析肠道菌群与系统性硬皮病的因果关系
Analyze the causal relationship between gut microbiota and systemic sclerosis and pathogenic bacteria based using Mendelian randomization
摘要目的 利用孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)分析肠道菌群与系统性硬皮病(systemic sclerosis,SSc)之间的因果关系.方法 获取肠道菌群和SSc的全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)数据,筛选出强工具变量(instrumental variable,IV),以逆方差加权法(inverse-variance weighting,IVW)为主,MR-Egger、加权中位数法(weighted median estimate,WME)作为补充,评价因果效应.再使用Cochran Q检验、MR-PRESSO检验、MR-Egger截距检验和留一法分析评估结果的稳健性.最后,绘制工具变量相关的森林图、散点图及漏斗图等.结果 MR分析共鉴定出 4 种肠道菌群(Collinsella属、Ruminococcaceae UCG003 属、Subdoligranulum属和NB1n目),均与SSc的关联效应值差异具有统计学意义(P<0.05).IVW:Collinsella属(OR:7.260;95%CI:1.595～33.057);Ru-minococcaceaeUCG003属(OR:5.046;95%CI:1.463～17.400);Subdoligranulum属(OR:0.150;95%CI:0.038～0.588);NB1n目(OR:0.389;95%CI:0.184～0.819);其余 2 种方法跟 IVW 法结果一致.Cochran Q 检验显示不存在异质性,MR-PRESSO检验没有发现离群值,MR-Egger截距检验表明结果不存在水平多效性,留一法分析支持结果的稳健性.结论 MR分析结果支持肠道菌群和SSc存在潜在的因果关系,Collinsella属和Ruminococcaceae UCG003 属与SSc发病风险呈正相关,Subdoligranulum属和NB1n目与SSc发病风险呈负相关,需要更多的研究来揭示肠道菌群如何影响SSc发病.
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