大肠杆菌MG1655菌株ERIC-PCR图谱主带序列组成分析
NON-RANDOM NATURE OF GENOMIC DNA AMPLIFICATION OF E.COLI K-12 MG1655 VIA ERIC-PCR
摘要ERIC-PCR已经在细菌分类、鉴定及混合菌群分析中得到广泛应用,但对其产物形成规律的认识仍存在分歧.以大肠杆菌MG1655为对象,对其EBIC-PCR指纹图谱中1.1kb主带中的DNA片段进行了克隆、测序、基因组定位以及引物匹配分析.结果表明,这条1.1kb主带由分布在基因组中不同位置的3种序列不同的片段组成,各片段的丰度差异较大,最高为97.89%;3种片段中的2种所在的基因组区域仅一端含有ERIC序列.推测对含有ERIC序列的基因组DNA进行扩增时,ERIC-PCR是一种非随机扩增.
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