川楝内生放线菌的分离及多样性研究

Isolation and diversity of endophytic actinomycetes from Melia toosendan

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摘要[目的]分离四川省各个地区川楝内生放线菌并研究其物种多样性.[方法]应用7种选择性分离培养基分离样品根、茎、叶、树皮和果实中的内生放线菌,采用16S rRNA基因RFLP分析代表菌株多样性.[结果]研究共获得403株内生放线菌.不同地点、不同植株部位、不同培养基分离得到的内生放线菌数目均有差异.广元采集的样品分离得到的数目最多,为86株;最少的是绵阳,仅有12株.从植物表皮中分离到148株放线菌,占获得菌株总数的36.7％;而从果中分离到31株,仅占获得菌株总数的7.6％;虽然从根部分离到的数量也很少,但是其出菌率却是最高的.5号和3号培养基的分离效果最为理想.16S rRNA基因RFLP分析结果显示所有供试菌株在68％的相似性上聚在一起,在84％的相似水平上分成了10个遗传类型.代表菌株的16S rRNA基因序列测定及系统发育分析结果表明:分离得到的放线菌包括4个属,分别是链霉菌属(Streptomyces)、北里孢菌属(Kitasatospora)、节杆菌属(Arthrobacter)、克里布所菌属(Kribbella).其中,链霉菌是优势类群,占代表菌株数目的比例高达91％,而稀有放线菌的比例只有9％.[结论]研究发现的川楝内生放线菌主要属于链霉菌属(Streptomyces)、北里孢菌属(Kitasatospora)、节杆菌属(Arthrobacter)、克里布所菌属(Kribbella).

作者陈萌 ^[1] 李小林 ^[2] 李强 ^[3] 张矛宇 ^[3] 张波 ^[4] 甘炳成 ^[5] 张小平 ^[4] 学术成果认领

作者单位四川农业大学资源环境学院四川成都611130;蒲江县农村发展局四川成都611630 ^[1] 四川农业大学资源环境学院四川成都611130;四川省农业科学院土壤肥料研究所四川成都610041 ^[2] 四川大学生命科学学院四川成都610065 ^[3] 四川农业大学资源环境学院四川成都611130 ^[4] 四川省农业科学院土壤肥料研究所四川成都610041 ^[5]

关键词 16SrRNA基因川楝内生放线菌分离物种多样性 16S rRNA genes Melia toosendan Endophytic actinomycetes Isolation Diversity

主题词性(Sex)研究(Research)基因(Genes)培养基(Culture Media)目的(Goals)

栏目名称

环境微生物

DOI 10.13344/j.microbiol.china.140453

发布时间 2015-03-31