临床分离志贺菌中CRISPR/Cas系统的分布及其与毒力基因的关系

Distribution of CRISPR/Cas system in Shigella clinical strains and its relationship with virulence genes

导出 OA 学术成果认领

摘要[目的]了解临床分离志贺菌中CRISPR/Cas系统的分布特征并分析其与毒力基因的关系.[方法]以聚合酶链式反应(PCR)方法,采用10对引物分别对57株临床分离志贺菌中CRISPR1、cas2-cas1、cas6e-cas5、cas7、cse2、cse1-cas3基因和毒力基因ipaH、ial、ipaBCD、virA进行检测.对CRISPR1的PCR结果进行测序,并用CRISPR finder在线软件对CRISPR1基因座进行分析.通过卡方检验初步分析CRISPR/Cas系统与毒力基因的关系.[结果]测序结果显示,CRISPR1基因座中间隔序列数目较少且在不同菌株间一致性较高;57株志贺菌中,84.2％(48/57)的志贺菌中可检测到CRISPR/Cas系统,其中68.8％ (33/48)的志贺菌中cas6e-cas5基因或(和)cse2基因中发现插入序列;毒力基因ipaH、ial、virA、ipaBCD的检出率依次为100％、100％、98.2％和87.7％;毒力基因ipaBCD的阳性率与活性CRISPR/Cas系统的分布无关(P＞0.05).[结论]CRISPR/Cas系统广泛存在于临床分离志贺菌中;部分cas基因中有插入序列;并未发现志贺菌中活性CRISPR/Cas系统与毒力基因的分布有关.