倭蜂猴粪便微生物苯酚羟化酶和邻苯二酚1,2-双加氧酶基因多样性研究

Analysis gene diversity of phenol hydroxylase and catechol 1,2-dioxygenase from fecal microbiome of Nycticebus pygmaeus

摘要[目的]分析倭蜂猴粪便微生物中苯酚羟化酶(Phenol hydroxylase,PH)和邻苯二酚1,2-双加氧酶(Catechol 1,2-dioxygenase,C12O)的基因多样性.[方法]利用简并引物,以倭蜂猴粪便微生物宏基因组DNA为模板,通过PCR扩增,分别构建PH和C12O基因克隆文库,并对克隆进行测序分析.[结果]倭蜂猴粪便微生物来源的PH和C12O基因序列经BLAST比对分析,与GenBank中相应酶的序列一致性分别介于92％-100％和87％-100％.系统进化树分析表明PH基因序列与Neisseria、Burkholderia、Alcaligenes、Acinetobacter4个属来源的PH序列相关;C12O基因序列全部与Acinetobacter来源的C12O序列相关.序列比对结果表明PH序列具有LmPH(Largest subunit of multicomponent PH)中高保守的两个DEXRH结构域;C12O序列具有能被Ag+和Hg2+抑制的位点(半胱氨酸).[结论]倭蜂猴粪便微生物来源的PH为多组分PH,其降解苯酚的中间产物邻苯二酚可以被C12O通过邻位开环途径裂解.