计算机辅助药物设计筛选嗜水气单胞菌AhyI合成酶抑制剂
Computer-aided drug design for discovery of small-molecule inhibitors of N-acyl-homoserine lactone synthase in Aromonas hydrophila
摘要[背景]AhyI合成酶在嗜水气单胞菌(Aromonas hydrophila)群体感应调控毒力产生中发挥着关键作用.[目的]研究其结构以寻找高效抑制剂,切断细菌致病性的源头,具有极其重要的意义.[方法]利用已解析的蛋白质结构为模板,运用同源模建和分子动力学模拟手段,成功建立了 AhyI合成酶的三维结构.接下来,基于先前研究的基础,选取2个高效抑制剂N-3-氧代己酰基高丝氨酸内酯(N-3-oxo-hexanoyl-homoserine lactone,NOO)和 5-脱氧-5-甲硫腺苷(5'-deoxy-5'-methylthioadenosine,MTA)以及传统中药中的部分活性成分,共选取214个候选配体与受体蛋白进行分子对接.[结果]筛选出4个潜在抑制剂,经过最小抑菌浓度(minimal inhibit concentration,MIC)值、生长曲线、紫色菌素、生物膜形成、胞外蛋白酶、群集运动和泳动实验验证后,发现青蒿素可以作为嗜水气单胞菌群体感应系统的高效抑制剂.[结论]传统中药青蒿素为水产养殖业中嗜水气单胞菌的有效防治提供基础,在治疗细菌感染方面具有广阔的应用前景.
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