换一批嗜酸氧化亚铁硫杆菌细胞色素C家族afe_0378基因转录表达差异及生物信息学挖掘
Differential of Transcription Expression & Bioinformatics Tapping of a Cytochrome c Family Gene of afe_0378 in Acidithiobacillus ferrooxidans
摘要嗜酸氧化亚铁硫杆菌是一种极为重要的浸矿微生物,具有氧化各种还原性含硫物及亚铁等功能.采用实时荧光定量PCR技术及生物信息学等手段对该菌一个涉及铁硫氧化由afe_0378基因编码的细胞色素C家族蛋白CycA2进行了研究.结果表明,afe_0378基因在单质硫培养条件下转录水平是亚铁培养条件下的2.67倍.生物信息学分析表明afe_0378编码蛋白CycA2是分子质量为22.959 ku,pI为9.75的结合内膜的周质蛋白,二级结构为全α-螺旋,无β-折叠,包含2个相似结构域及N端一段跨膜疏水螺旋,属于细胞色素C4型蛋白家族.CycA2蛋白分子三维结构模建表明,双血红素与CycA2蛋白序列片段域C48-X-X-C51-H52及C149-X-X-C152-H153中的半胱氨酸共价连接.结合该菌硫代谢背景知识,推测CycA2蛋白的功能是介导细胞色素bc1复合体及终端氧化酶细胞色素aa3复合体之间的电子传递而参与硫代谢.
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关键词
嗜酸氧化亚铁硫杆菌细胞色素C4型蛋白实时荧光定量PCR生物信息学Acidithiobacillus ferrooxidanscytochrome C4 proteinqRT-PCRbioinformatics
分类号
Q81（生物工程学《生物技术》）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1005-7021.2014.02.002
发布时间
2014-08-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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