换一批紫色红曲霉Mp-21 MpMcrA基因的克隆与生物信息学分析
Cloning and Bioinformatics Analysis of Mp-21 MpMcrA Gene from Monascus purpureus
摘要McrA为最近在构巢曲霉(Aspergillus nidulans)中发现的全局调控因子,具有调控丝状真菌生长发育和次级代谢的作用,利用生物信息学分析方法找到并克隆紫色红曲霉(Monascus purpureus)中mcrA基因,将其命名为MpMcrA.分析MpMcrA蛋白质理化性质、亲疏水性、亚细胞定位、信号肽、跨膜区域及磷酸化位点、转录因子结合位点以及蛋白质二级结构.利用ProtParam、ProtScale、PSORTII、SignalP4.1等生物信息学软件对MpMcrA进行系统分析.结果表明,MpMcrA基因长1 356 bp,其中含有3个外显子,2个内含子,编码410个氨基酸,与构巢曲霉序列比对蛋白相似性高达64％.预测结果显示,MpMcrA属于亲水蛋白,位于细胞核可能性大,不存在跨膜区域,不属于膜蛋白;不存在剪切位点,不属于分泌蛋白;基因含有54个潜在的磷酸化位点;可能存在5个转录因子结合位点;蛋白结构大部分为无规则卷曲,整体结构较松散.对MpMcrA基因进行了生物信息学分析,得到了基因特征和分析结果.初步确定MpMcrA基因为构巢曲霉同源mcrA 基因,在红曲霉中未见有报道.
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关键词
紫色红曲霉全局调控因子生长发育次级代谢生物信息学MpMcrA基因Monascus purpureusgeneral regulatory factorgrowth and developmentsecondary metabolismfunction predictionMpMcrA gene
分类号
Q933（微生物学遗传学）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1005-7021.2023.03.002
发布时间
2023-07-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（31570013）
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