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一株产低温蛋白酶地衣芽胞杆菌NWMCC0046全基因组测序及分析

Complete Genome Sequence and Analysis of Bacillus licheniformis NWMCC0046 Producing Cryo-Protease

摘要地衣芽胞杆菌(Bacillus licheniformis)NWMCC0046是从西藏日喀则地区屠宰场废弃血污放置土壤中分离得到的一株益生菌,产生的碱性蛋白酶在低温下有作为洗涤剂添加酶的潜力.深入分析菌株NWM-CC0046的基因组序列信息,并挖掘该菌株功能特性基因及潜在应用价值.使用PacBio RS Ⅱ平台和Illumina HiSeq 4000平台对菌株NWMCC0046的基因组进行测序,并对测序数据进行基因组组装、基因预测与功能注释、共线性分析、进化分析及次级代谢产物合成基因簇预测.菌株NWMCC0046全基因组大小为4 321 565 bp,平均GC含量为46.78%,共编码4 504个基因.基因注释揭示了其益生菌特性,如胃肠道内独特的适应性、抗氧化活性和抗菌活性.此外,菌株NWMCC0046还编码工业上许多重要的酶.进化树及共线性结果表明,菌株NWMCC0046属地衣芽胞杆菌且与地衣芽胞杆菌ATCC 14580具有较好的共线性.同时,预测到菌株NWMCC0046中有11个次级代谢产物合成基因簇,编码地衣素、丰原素、杆菌肽和丁酰苷菌素等生物活性物质.基因组信息存储于GenBank,登录号为CP090312.菌株NWMCC0046全基因组数据为其益生特性提供基础数据,对菌株NWMCC0046后续相关研究具有重要意义.

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作者 周魏 [1] 余金凤 [1] Mohd Sobri Takriff [2] 向军 [1] 马忠仁 [1] 丁功涛 [1] 周雪雁 [3] 张福梅 [1] 学术成果认领
作者单位 西北民族大学生物医学研究中心,甘肃兰州 730030 [1] Universiti Kebangsaan Malaysia,Department of Chemical and Process Engineering,Selangor Bangi 43600 MALAYSIA [2] 西北民族大学生物医学研究中心,甘肃兰州 730030;西北民族大学生命科学与工程学院,甘肃兰州 730124 [3]
栏目名称
DOI 10.3969/j.issn.1005-7021.2023.06.005
发布时间 2024-03-04(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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微生物学杂志

微生物学杂志

2023年43卷6期

42-53页

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