换一批辽宁省首株柯萨奇病毒B组5型全基因组序列分析
Whole Genome Sequnce Analysis of The First Coxsackievirus B5 Strain in Liaoning Province
摘要研究引起辽宁地区手足口病的柯萨奇病毒B组5型(coxsackievirus B5,CV-B5)基因组特征.对2018年从辽宁省688份肠道病毒核酸阳性的标本中分离到的 1株CV-B5进行高通量测序,并对其全基因组进行遗传进化分析.结果表明,CV-B5辽宁分离株与国内流行株的全基因组核苷酸序列同源性为78.5％～97％,氨基酸序列同源性为75.3％～96.7％.基于全基因组的进化分析将CV-B5流行株分为A～D四个基因型,辽宁分离株属于D基因型.通过重组分析发现其在P3区的3D区段发生重组.首次在辽宁地区手足口病患儿中分离出CV-B5,辽宁省分离株(LN2018-23-21/CHN/2018)可能为重组株.
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关键词
手足口病柯萨奇病毒B组5型(CV-B5)全基因组遗传进化分析hand-foot-and-mouth disease(HFMD)coxsackievirus B5(CV-B5)whole genomegenetic evolution-ary analysis
分类号
Q939.93（应用微生物学）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1005-7021.2023.06.011
发布时间
2024-03-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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