金针菇细胞周期蛋白编码基因fvccnl的鉴定及表达分析
Identification and Expression Analysis of a Cycling-Encoding Gene fvccnl in Needle Mushroom(Flammulina filiformis)
摘要为探索细胞周期蛋白在食用菌生长发育过程中的作用,基于金针菇(Flammulina filiformis)的基因组和转录组数据筛选得到一个假定细胞周期蛋白编码基因fvccnl,并对其基因结构、蛋白质基本性质、分子进化、蛋白质比对与表达模式进行分析.结果表明,fvccnl基因全长1 767 bp,含有5个外显子及4个内含子,CDS长度为1 563 bp,编码蛋白含520个氨基酸,预测分子量为59 099.95 Da,等电点为5.01.保守域与分子进化分析结果显示,Fvccnl蛋白具有Cyclin_N与CYCLIN两个保守结构域,均系典型的细胞周期蛋白保守域,属于细胞周期蛋白超家族成员;Fvccnl与子囊菌和动物的B类细胞周期蛋白进化关系较近,而与动物D类和子囊菌CLN型细胞周期蛋白关系较远.实时荧光定量PCR结果表明,fvccnl在原基、菌柄和菌盖中的表达量分别是菌丝的3.2、9.1和4.2倍,在菌柄伸长部位的表达量是非伸长部位的11倍,推测fvccnl对金针菇子实体的发育,尤其是对菌柄的伸长具有重要作用.
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