换一批生物信息学和分子对接分析HuNoVs非结构蛋白NS3
Bioinformatics and Molecular Docking Analysis on the Nonstructural Protein NS3 of HuNoVs
摘要为了深入探究人类诺如病毒(Human noroviruses,HuNoVs)的NS3非结构蛋白的结构特征和小分子药物,运用多种生物信息学方法 ProtParam、ProtScale、SignalP 5.0、TMHMM 2.0、NCBI Conserved Domains、SOPMA、SWISS-MODELAYinOYang 1.2、NetPhos 3.1、ABCpred、SYFPEITHI、Prankweb 和 Discovery Studio 等预测 NS3 蛋白的同源性、理化性质、翻译后修饰位点、二级/三级结构、B/T细胞抗原表位、活性口袋位点及抑制化合物.HuNoVs的NS3蛋白是由363个氨基酸组成的稳定亲水性蛋白,相对分子量为39 748.79 Da,理论等电点为6.37;NS3蛋白与其他病毒解旋酶序列相似性为32.52％,无信号肽和跨膜结构,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,具有2个功能结构域,38个O-糖基化位点和21个磷酸化位点,7个B-细胞抗原表位和19个T-细胞抗原表位;还存在6个活性口袋位置和5个潜在的小分子抑制化合物.本文为阐明人类诺如病毒非结构蛋白NS3的结构和在病毒性肠胃炎中的作用机制提供了理论依据,也为研发和筛选新疫苗和药物奠定了基础.
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分类号
Q936（微生物生物化学）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1005-7021.2025.01.010
发布时间
2025-03-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
中南大学湘雅二医院护理科研基金（2023-HLKY-36）
湖南省财政厅卫生科技计划项目（202030229）
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