应用高通量测序研究三文鱼片冷藏过程中的菌相变化
Characterization of Salmon Bacterial Community Structure during Refrigerated Storage Using the High-Throughput Sequencing
摘要分析三文鱼片在冷藏过程中的微生物群落多样性及菌相变化,确定其优势腐败菌.以4℃冷藏条件下三文鱼片为研究对象,分别于第0、1、2、3、4天提取鱼片上的细菌总DNA,采用高通量测序技术分析细菌群落变化,确定其优势菌.结果 表明,高通量测序分析共获得281个菌属,其中丰度大于1%的有6个,大于0.1%的有16个.在三文鱼冷藏过程中,其菌相不断变化,但其主要优势菌属保持不变,主要为假单胞菌属、发光杆菌属、希瓦氏菌属、不动杆菌属、黄杆菌属及金黄杆菌属,且随着储存时间的延长,假单胞菌属的丰度(优势性)逐渐增加.
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